Na de opheffing van de WIC in 1791 werd de Raad der Koloniën in het leven geroepen om zich met de lopende zaken van de compagnie bezig te houden. Het archief bestaat onder meer uit financiële stukken, resoluties en correspondentie met de Staten-Generaal, de voormalige bestuurskamers van de WIC en de koloniën.
handelsondernemingen
Archief OWIC, 1621-1711 (Nationaal Archief)
De Oude West-Indische Compagnie was actief van 1621 tot aan haar faillissement in 1674. Het archief bestaat uit stukken van de bestuurskamers in Amsterdam, Delft, Zeeland, het Noorderkwartier en op de Maze, van het Haags Besogne waarin de kamers onderling overleg voerden, en van het centrale bestuurscollege, de Heren XIX. De documenten gaan onder meer over de Kust van Guinea en Nederlands-Brazilië.
Archief Nederlandse Factorij Japan, 1609-1860 (Nationaal Archief)
Archief van de Nederlandse handelspost in Japan, eerst in Hirado en daarna in Deshima gevestigd. Onder de documenten bevinden zich dagregisters, financiële, juridische en notariële stukken, resoluties en correspondentie.
Archief Nederlandse Bezittingen Voor-Indië, 1703-1826 (Nationaal Archief)
Dit archief omvat delen van archieven uit handelsposten van de VOC in Bengalen, Coromandel, Madura en Surat, bestaande uit correspondentie, dagregisters en resoluties.
Archief Levantse Handel, 1614-1828 (Nationaal Archief)
Archief van de Directie van de Levantse Handel en van de Navigatie op de Middellandse Zee, een samenwerkingsverband van colleges in Amsterdam, Rotterdam, Hoorn en Middelburg dat oorlogsschepen equipeerde om Nederlandse koopvaardijschepen in de Middellandse Zee te beschermen. Het archief bestaat onder meer uit correspondentie, financiële stukken, plakkaten en resoluties.
Archief Kust van Guinea, 1658-1872 (Nationaal Archief)
Met de Kust van Guinea wordt verwezen naar de Nederlandse bezittingen op de Afrikaanse westkust, met name in het huidige Ghana. Het archief bestaat uit twee delen, verdeeld over de jaren 1658-1816 en 1816-1872. Beide gedeeltes bevatten journalen uit het fort Sint George d’Elmina, het middelpunt van het Nederlandse gezag in West-Afrika. Van de tweede periode is daarnaast ook correspondentie met andere posten op de kust aanwezig.
Archief Hoge Regering Batavia, 1602-1827 (Nationaal Archief)
Stukken uit het archief van het centrale bestuursorgaan van de VOC in Azië, de Hoge Regering te Batavia. De documenten bevatten informatie over het bestuur aldaar en van de vele handelsposten in de rest van Azië. Het originele archief van de Hoge Regering bevindt zich in het Arsip Nasional Republik Indonesia (ANRI) te Jakarta.